На півдні острова розташоване одне з найбільш вражаючих природних чудес, яке відоме своїм капаючим багатством і блакитними водами. У "блакитній печері" Кастелорізо живуть тюлені, які зазвичай невидимі для відвідувачів. Висота печери 35 метрів, ширина 40 метрів, а довжина печери всередині 75 метрів. Однак її вхід між водою та скелею настільки малий, що важко сказати яка висота буде через деякий час. Печер вкритий білими сталактитами, які є одним із найрідкісніших геологічних явищ на Землі. Коли сонячні промені потрапляють у печеру, сталактити набувають унікальних кольорів, а вода стає блакитною, що миттєво приголомшує кожного відвідувача. Найкращий час для відвідування печери, це ранок. Відвідування печери здійснюється тільки на човні і, звісно, в гарну погоду, але заплисти до печери можна тільки на невеликих човнах. Коли піднімається вітер і починається шторм вхід закритий і печера недоступна. Крім знаменитої Блакитної печери, в Кастелорізо є ще чотири печери рідкісної геологічної краси: Фотсалікі, Колонес, печера Арнауті і Катранці.