Die Visitenkarte von Zakynthos sind neben der Navagio-Bucht die Blauen Höhlen. Die Blauen Höhlen sind eine der bekanntesten Naturattraktionen der Insel. Sie befinden sich im Nordosten der Insel und können mit dem Boot, einem Ausflugsboot oder schwimmend besichtigt werden. Die Höhlen sind ein seltenes geologisches Phänomen, bei dem sich viele Grotten und bizarre Höhlen in steilen Felsen gebildet haben. Einige sind so groß, dass man sie mit einem kleinen Boot von innen besichtigen kann, während andere nur für Taucher und Menschen, die gut unter Wasser schwimmen können, zugänglich sind. Ungewöhnliche Steinbögen, ein von Menschenhand geschaffenes Wunder, das von den Meereswellen geformt wurde. Die Einheimischen empfehlen einen Besuch der Blauen Höhlen am Abend oder in der Morgendämmerung, wenn das Sonnenlicht auf die Höhlen trifft und sie ihre Schönheit offenbaren. Die märchenhaften Höhlen sind vom Land aus nicht zugänglich, sondern nur vom Meer aus, und ihre Tiefe beträgt durchschnittlich vier Meter. Es wird nicht empfohlen, die Höhlen bei stürmischem Wetter zu besuchen: Das Baden wird an solchen Tagen gefährlich. Das Wasser der schneeweißen Höhlen enthält viel Kalzium und Mineralien und hat daher eine günstige Wirkung auf die Haut.